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吐露科技生态
2020/03/10

最新进展：CRISPR技术用于SNP、病毒RNA、环状RNA，甚至DNA甲基化检测

最新进展：CRISPR技术用于SNP、病毒RNA、环状RNA，甚至DNA甲基化检测

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本周（2019年9月18日），ACS synthetic biology在线刊出CRISPR-Cas12b用于核酸检测和DNA甲基化定量的文章（HOLMESv2: a CRISPR-Cas12b-assisted platform for nucleic acid detection and DNA methylation quantitation；https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acssynbio.9b00209），这是吐露港公司与中科院、上海师范大学、上海科技大学等单位共同研究的最新成果。李林显、李诗渊和吴娜是本文的共同第一作者。


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下一代基于CRISPR的分子诊断学具有快速、准确和便携性等的优点。之前，吐露港公司与中科院合作发现过Cas12a对旁路单链DNA (ssDNA)的反式切割活性（可参见往期的公众号，点击链接），并利用该活性开发了一种快速核酸检测系统，即HOLMES(one-HOur Low-cost Multipurpose highly Efficient System，1小时低成本多用途高效系统)。


在这里，利用热稳定的CRISPR-Cas12b蛋白，研究人员为创建了升级版的检测方法HOLMESv2，并且创建了4个应用场景。

这些结果突出了HOLMESv2作为分子诊断和表观遗传学应用的一个有前景的平台的潜力。

01
特异性鉴别单核苷酸多态性(SNP)

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02
检测病毒RNA、人细胞mRNA和环状RNA

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03
在恒温条件下，采用单步系统结合LAMP扩增，方便定量目标核酸，避免交叉污染

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04
结合Cas12b检测和亚硫酸氢盐处理，准确定量目标DNA甲基化程度

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