微生物基因组编辑整体解决方案

1. CRISPR介导的基因组编辑简介

在细菌和古细菌中发现的规律成簇间隔短回文重复序列(clustered regularlyinterspaced short palindromic repeat，CRISPR) ，能在基因水平上有效地抵抗噬菌体和外界各种基因元件的侵害。CRISPR相关蛋白（Cas）是一种RNA介导的双链DNA核酸内切酶，可以剪切外来DNA。只有当入侵的DNA中的目标序列中出现保守的间隔相邻基序（protospacer adjacentmotif，PAM）时，DNA 序列将被在PAM上游的spacer序列内定点切割（4-5nt）。由于CRISPR-Cas9系统只需要Cas9单个核酸内切酶即可完成反应，体系比较灵活简单，特异性高，细胞毒性小，已经成为一项热门的基因组编辑技术，被广泛应用于基因组工程领域。( DOI:10.103454/i.sds.2018.08.20)。

图片摘自Doudna JA,Charpentier E.Science 2014;346:1258096

2. 吐露港生物科技有限公司的服务内容

吐露港生物科技近期推出CRISPR方法进行微生物的基因组改造服务（包括基因敲除、定点突变、定点插入外源序列等）。相比于传统的基因敲除方法，该方法速度快，并可实现无痕；因此更加方便进行后续的实验。

目前已经研发成功的CRISPR平台包括： 大肠杆菌、 干酪乳杆菌、 沙门氏菌、 链霉菌（ 含模式天蓝色链霉菌和常见的链霉菌）、 金黄色葡萄球菌、 谷氨酸棒杆菌、 塔特姆式菌、 恶臭假单胞菌、 产溶剂梭菌（ 及其它常见的梭菌）、 枯草芽孢杆菌、 酿酒酵母、 解脂耶氏酵母（ 需咨询）、 丝状真菌（ 需咨询） 等。

公司同时具备利用同源重组方法进行基因组编辑的能力，其中成熟的物种包括：大肠杆菌、链霉菌（PCR-targeting）、分枝杆菌（耻垢分枝杆菌、牛分枝杆菌、鸟分枝杆菌、海分枝杆菌、结核分枝杆菌等）、白色念珠菌等。 大肠杆菌、链霉菌（PCR-targeting）、分枝杆菌（耻垢分枝杆菌、牛分枝杆菌、鸟分枝杆菌、海分枝杆菌、结核分枝杆菌等）、白色念珠菌等。

对于某些不太常见的微生物物种， 公司可以代为开发针对该物种的基因组编辑系统。